Продукты

5-метилцитозиндиоксигеназы Tet катализируют деметилирование ДНК, продуцируя 5-гидроксиметилцитозин и другие продукты окисления.Tet1 и Tet2 в высокой степени экспрессируются в плюрипотентных клетках мыши и в разной степени подавляются в соматических клетках, но механизмы транскрипции неясны.Здесь мы определили промоторные и энхансерные домены в Tet1 и Tet2.Внутри «суперэнхансера» Tet1 размером 15 т.п.н. есть два сайта начала транскрипции (TSS) с разными паттернами активации во время развития.Промоторная область размером 6 т.п.н. выше дистального TSS является высокоактивной в наивных плюрипотентных клетках, автономно сообщает об экспрессии Tet1 в трансгенной системе и быстро подвергается метилированию ДНК и молчанию при дифференцировке в культивируемых клетках и нативном эпибласте.Второй нижележащий TSS, связанный с конститутивно слабым CpG-богатым промотором, активируется соседним энхансером в наивных эмбриональных стволовых клетках (ESCs) и праймированных эпибластоподобных клетках (EpiLCs).Tet2 имеет островковый промотор CpG с плюрипотентно-независимой активностью и ESC-специфический дистальный внутригенный энхансер;последний быстро подавляется в EpiLCs.Наше исследование выявляет различные способы регуляции транскрипции в Tet1 и Tet2 во время переходов состояний клеток на раннем этапе развития.Новые трансгенные репортеры, использующие цис-регуляторные домены Tet1 и Tet2, могут служить для различения тонких изменений в плюрипотентных состояниях и лежащих в их основе эпигенетических вариаций.