Бактерии толстой кишки, примером которых являются Bacteroides thetaiotaomicron, играют ключевую роль в поддержании здоровья человека, используя большие семейства гликозидгидролаз (GH) для использования пищевых полисахаридов и гликанов хозяина в качестве питательных веществ.Такое расширение семейства GH иллюстрируется 23 гликозидазами семейства GH92, кодируемыми геномом B. thetaiotaomicron.Здесь мы показываем, что это альфа-маннозидазы, которые действуют через единый механизм замещения, чтобы использовать N-гликаны хозяина.Трехмерная структура двух маннозидаз GH92 определяет семейство двухдоменных белков, в которых каталитический центр расположен на границе домена, обеспечивая кислотную (глутамат) и основную (аспартат) помощь гидролизу в Ca(2+)- зависимый способ.Трехмерные структуры GH92 в комплексе с ингибиторами дают представление о специфичности, механизме и конформационном маршруте катализа.Ca(2+) играет ключевую каталитическую роль, помогая исказить маннозид от его основного состояния (4)C(1) конформации стула к переходному состоянию.
